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黄晓军于1987年毕业于中山医科大学医疗系；1992年获得北京医科大学获医学博士学位；1997—1998年在美国阿尔伯特·爱因斯坦医学院肿瘤研究中心从事血液恶性肿瘤新的研究；2005年任北京大学血液病研究所所长 ；2007年获得“国家杰出青年科学基金”资助；2012年入选“科技北京百名领军人才”；2013年入选“国家百千万人才工程”；2017年3月入选“中国十大医学新闻人物”；2022年当选为中国医学科学院学部委员；2023年当选法国国家医学科学院外籍通讯院士；2023年11月，当选为中国工程院院士。
北京大学人民医院血液科黄晓军加急住院挂号）兼任亚太血液联盟常委会主任、世界华人医师协会第四届理事会副会长、第四、五届中国医师协会血液科医师分会会长、第九届中华医学会血液学分会主委。
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【社会任职】
《中国实用内科杂志》副主编
《中国学杂志》副主编
《中华医学杂志英文版》编委
《中华医学杂志》编委
《中国医学论坛》报血液肿瘤专刊副主编
《国际输血及血液学杂志》编委
《中国实验血液学杂志》副主编
血液学分会常务委员
北京医师专家委员
北京市血液肿瘤专业委员
个人经历： 1982.9-1987.7 中山医科大学医疗系学士学位 1987.9-1992.7 北京医科大学博士学位 1997-1998 美国Einstein医学院肿瘤研究中心访问学者 1992.12-1994.9 北京大学人民医院血液病研究所主治医师 1994.9-1998.6 北京大学人民医院血液病研究所副主任医师 1998.6-2001.8 北京大学人民医院血液病研究所副教授 2001.8-2002.8 北京大学人民医院血液病研究所主任医师 2002.8-至今北京大学人民医院血液病研究所教授/所长